Η βασική ερευνητική δραστηριότητα της ΜοΚΕ-ΕΜΠ περιλαμβάνει την παραγωγή και προαγωγή γνώσης πάνω στην καινοτομία και την επιχειρηματικότητα. Οι βασικές ενότητες και πυλώνες πάνω στους οποίους κινείται και στηρίζεται η ΜοΚΕ-ΕΜΠ είναι:
- Η διεξαγωγή ερευνών και μελετών της επιχειρηματικότητας και των καινοτομικών πρωτοβουλιών και δράσεων των νέων αποφοίτων του ΕΜΠ.
- Η αξιοποίηση ευρημάτων συναφών ερευνών για την καινοτομία και την επιχειρηματικότητα (GEM, AGER, ΕΒΕΟ, ΙΟΒΕ, Στέγη της Ελληνικής Βιομηχανίας).
- Συμμετοχή σε διεθνή και εθνικά ερευνητικά δίκτυα και προγράμματα που ασχολούνται με θέματα επιχειρηματικότητας (AEGIS, Cre8tv.eu)
- Συμμετοχή σε διεθνή συνέδρια για την καινοτομία και την επιχειρηματικότητα (DRUID, ZEW, T2S, ISS, EAPE) με συγκεκριμένες ανακοινώσεις σχετικά με την επιστημονική διερεύνηση της καινοτομίας και της επιχειρηματικότητας.